2000 m. LFF II lygos Pietų zona – LFF II lygos varžybų dalis. 9 komandų varžybos prasidėjo 2000 m. balandžio 28 d. ir tęsėsi iki 2000 m. lapkričio 4 d. Sekantis varžybų sezonas - 2001 m. LFF II lygos Pietų zona.