2006 m. Moterų A lyga – Lietuvos 1 lygmens varžybos, 8 Moterų futbolo A lygos sezonas. 8 komandų varžybos prasidėjo 2006 m. ir tęsėsi iki 2006 m. spalio 15 d.
Prieš šį sezoną organizuotos 2000 m. Moterų futbolo čempionato varžybos, kitą sezoną - 1994 m. Moterų futbolo čempionatas.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 54 rungtynės, įmušti 267 įvarčiai.
Daugiausiai rungtynių nepelnant įvarčių – 7 rungtynės (Nemenčinės „Rūta-Consena“ - nuo 2006 m. balandžio 29 d. iki 2006 m. birželio 3 d. ir Vilniaus „Elena“ - nuo 2006 m. gegužės 31 d. iki 2006 m. rugsėjo 30 d.)
Rungtynės, kuriose svečiams pavyko pelnyti daugiausiai įvarčių – 0 : 10 (2006 m. rugpjūčio 30 d. Alytaus SRC - Vilniaus „Vėtra“)