1999 m. LFF II lygos Vakarų zona – LFF II lygos varžybų dalis. 12 komandų varžybos prasidėjo 1999 m. rugpjūčio 13 d. ir tęsėsi iki 1999 m. spalio 28 d.
Prieš šį sezoną organizuotos 2002 m. LFF II lygos Šiaurės zonos varžybos, kitą sezoną - 2000 m. LFF II lygos Vakarų zona.